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海云基因聯(lián)合烈冰科技達成醫(yī)療云計算平臺開發(fā)戰(zhàn)略合作! 時間:2016-10-26
 2016年10月25日,上海海云生物科技有限公司(以下簡稱“海云基因”)聯(lián)合上海烈冰信息科技有限公司(以下簡稱“烈冰科技” )共同開發(fā)的醫(yī)療云計算平臺GeneApps? 2.0隆重上線。出席本次簽約儀式的有海云基因董事長潘峰先生和烈冰科技董事長宗杰先生。。

精準醫(yī)療,云計算勢在必行
美國總統(tǒng)奧巴馬宣布啟動精準醫(yī)療行動后,國內(nèi)政策密集推動,2016年3月,精準醫(yī)療入選十三五100個重大項目?;驕y序是精準醫(yī)療的前端,健康基因檢測產(chǎn)業(yè)乘風飛起,現(xiàn)預估測序市場總?cè)萘窟_200億美元。HiSeq X Ten一天時間能產(chǎn)生6T數(shù)據(jù),足以得到50個人類基因組,精準醫(yī)療開啟的大數(shù)據(jù)時代已正式到來。 但是,實際應用中對大數(shù)據(jù)處理的運算速度、穩(wěn)定性、可重復性的要求亦迅速提升。生物信息工具使用頻次和分析通量的快速提升,算法、軟件的不斷進步和豐富,都讓分析人員自行尋找和改良算法成為一件相當繁瑣的工作。生物云計算系統(tǒng)吸取互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)經(jīng)驗,在人力成本極低的情況下即可輕松解決數(shù)據(jù)管理、存儲、分析的問題。


深度合作,出擊開發(fā)醫(yī)療云
上海烈冰信息科技有限公司是一家專注于生命科學研究與大數(shù)據(jù)挖掘的高新技術(shù)企業(yè),主營業(yè)務涵蓋生物云計算、科研服務和轉(zhuǎn)化醫(yī)學三大領(lǐng)域。列冰科技具有專業(yè)生物背景和六年科研服務經(jīng)驗,積累深厚,服務于國內(nèi)200多家科研機構(gòu),協(xié)助發(fā)表論文累計影響因子300以上。
海云生物科技圍繞基因檢測與云計算大數(shù)據(jù)分析來構(gòu)筑產(chǎn)品服務生態(tài)圈,具備生物技術(shù)(BT)與計算機技術(shù)(IT)化學反應般融合的技術(shù)與管理團隊,海云基因核心技術(shù)開發(fā)人員主要來自原惠普公司的云計算架構(gòu)團隊,在云計算及大數(shù)據(jù)處理上有豐富的經(jīng)驗,曾經(jīng)負責過中國聯(lián)通、中國移動的云平臺開發(fā)項目。去年年底海云基因在業(yè)內(nèi)率先實現(xiàn)在線共享的基因云計算分析平臺GeneApps? 1.0后,通過一年來的匠心打造,特別是在近半年與烈冰科技的合作,在其豐富的生物信息經(jīng)驗,以及烈冰科技開發(fā)的基因大數(shù)據(jù)分析平臺(NovelBrain®)的經(jīng)驗支持下,雙方投入幾百萬元以及二十余名計算機開發(fā)人員和生物信息研發(fā)人員,合作推出海云基因云計算系統(tǒng)GeneApps? 2.0上線。
通過本次合作,使GeneApps? 2.0醫(yī)療云計算框架具備一套集高性能計算,項目管理,生物智能挖掘框架為一體的整合分析管理平臺,其中hadoop分布式計算框架,云計算底層技術(shù)已實現(xiàn),并針對藥物基因組學、個性化用藥、基因體檢、遺傳性疾病、多發(fā)性腫瘤、液體活檢等應用開發(fā)了可拓展功能的API接口。平臺設(shè)計了疾病數(shù)據(jù)庫開發(fā)模塊,可輕松實現(xiàn)公共數(shù)據(jù)庫錄入、患者數(shù)據(jù)庫構(gòu)建和定制化數(shù)據(jù)庫等功能,同時也支持結(jié)果報告定制、數(shù)據(jù)Panel定制等一系列定制化服務。
優(yōu)化的GeneApps? 2.0版本,具備基因組、外顯子組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、微生物宏基因組和表觀遺傳學等模塊,現(xiàn)已實現(xiàn)數(shù)十條自動化分析流程,具備百余個生信功能task簇,不僅能充分滿足用戶標準化數(shù)據(jù)分析需求,還能根據(jù)用戶的需求個性化選取添加新的task,實現(xiàn)完美的定制化分析流程服務。同時,通過烈冰科技提供的私有云計算框架,使用分布式計算和任務調(diào)度來加速數(shù)據(jù)分析速度和通量,大大提升數(shù)據(jù)分析效率和定制化水平,可進行大規(guī)模的數(shù)據(jù)處理。

海云基因與烈冰科技旨在打造更加優(yōu)質(zhì)的基因檢測服務與數(shù)據(jù)分析平臺,充分發(fā)揮各自優(yōu)勢,不僅為廣大客戶快速提供較大數(shù)據(jù)量的生物信息分析服務,也為精準醫(yī)學測序企業(yè)、科研部門及醫(yī)院提供私有云平臺開發(fā)服務,使用戶進行更安全、更自由地數(shù)據(jù)分析。
雙方通過長達一年的技術(shù)交流與相互了解,最終達成了此次合作,希望為研發(fā)團隊、科研機構(gòu)、臨床研究、檢測/測序服務商等提供高品質(zhì)的基因檢測與數(shù)據(jù)解讀服務。同時,雙方也將以此次合作為契機,持續(xù)開展一系列交流合作,強強聯(lián)合,促使生命科學向更高層的研究領(lǐng)域突破。