單細(xì)胞測序研究進(jìn)展及細(xì)胞捕獲原理

l  單細(xì)胞測序研究進(jìn)展；

l  兩大主流平臺(tái)10×和BD單細(xì)胞捕獲原理；

l  10×和BD單細(xì)胞捕獲的優(yōu)缺點(diǎn)；

l  10×和BD建庫方法；

l  TCR、BCR、靶向測序、Ab-Seq等技術(shù)相關(guān)知識(shí)介紹；

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)及案例分析

l  單細(xì)胞測序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——腫瘤；

l  單細(xì)胞測序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——神經(jīng)；

單細(xì)胞測序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理

l  10×和BD下機(jī)原始數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)講解；

l  10×和BD 不同平臺(tái)的數(shù)據(jù)預(yù)處理策略；

l  細(xì)胞數(shù)量判斷；

l  數(shù)據(jù)質(zhì)量評估；

l  數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化；

單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析策略

l  單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析流程，包括細(xì)胞類型鑒定、擬時(shí)序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等；

l  單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析涉及的相關(guān)生物信息學(xué)算法和數(shù)據(jù)庫的介紹和選擇；

單細(xì)胞云平臺(tái)介紹及上機(jī)實(shí)踐操作

l  單細(xì)胞云平臺(tái)功能模塊介紹，包括項(xiàng)目管理、工作流搭建、數(shù)據(jù)進(jìn)程監(jiān)控、結(jié)果報(bào)告和單細(xì)胞瀏覽器等；

l  單細(xì)胞云平臺(tái)實(shí)際操作，包括新建項(xiàng)目、上傳數(shù)據(jù)、搭建Pipeline、數(shù)據(jù)分析；

單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果圖形化展示

l  如何通過云平臺(tái)獲得可供SCI發(fā)表的圖形化結(jié)果

單細(xì)胞結(jié)果解讀及參數(shù)調(diào)試

l  單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果文件解讀；

l  Task參數(shù)在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的重要性

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)注意事項(xiàng)

l  單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)基本流程；

l  單細(xì)胞懸液制備注意事項(xiàng)；

單細(xì)胞懸液制備和捕獲實(shí)驗(yàn)操作

l  小鼠來源樣本單細(xì)胞懸液制備；

l  WTA/Ab-Seq實(shí)驗(yàn)演示；