轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)常見,但操作絲滑流暢的分析平臺(tái),還得看烈冰的CytoNavigatorTM2023年9月發(fā)布至今,半年時(shí)間已有100多個(gè)課題組使用烈冰生物的CytoNavigatorTM單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)挖掘單細(xì)胞生物學(xué)意義。烈冰團(tuán)隊(duì)再接再厲,開發(fā)了CytoNavigatorTM轉(zhuǎn)錄組分析系統(tǒng),全流程打通了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,并實(shí)現(xiàn)了毫秒級(jí)響應(yīng)的GO/Pathway、網(wǎng)絡(luò)分析,以及高可交互的WGCNA、GSEA、趨勢(shì)分析等高級(jí)數(shù)據(jù)分析!
圖1:CytoNavigator 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)的差異基因頁面
轉(zhuǎn)錄組分析流程成熟,分析平臺(tái)眾多。但目前的分析系統(tǒng)普遍存在結(jié)果碎片化、分析不夠流暢,可交互性差,需反復(fù)上傳基因表格等問題?;谏鲜銮闆r,擁有多年轉(zhuǎn)錄組及生信云平臺(tái)經(jīng)驗(yàn)的烈冰生物重拳出擊!
正式推出CytoNavigatorTM 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)!一次解決RNA-seq分析的痛點(diǎn),讓您享受數(shù)據(jù)分析的過程,輕松獲得高質(zhì)量文章級(jí)圖片。
01 烈冰的傳統(tǒng)強(qiáng)項(xiàng)-轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)
烈冰生物自2010年起即深耕轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域,公司自主研發(fā)了多個(gè)轉(zhuǎn)錄組相關(guān)算法,如發(fā)表在期刊核酸研究以及Briefings In Bioinformatics上的差異可變剪接算法ASD和CASH等;并助力研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表Nature、Cancer Cell在內(nèi)的300+ 高質(zhì)量轉(zhuǎn)錄組相關(guān)學(xué)術(shù)期刊文章,如助力中科院頂級(jí)研究團(tuán)隊(duì)在Nature發(fā)表全球首例自閉癥猴模型等。
圖2:引自 Liu Z, et al. Nature., 2016
2023年9月,烈冰上線了CytoNavigatorTM單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),并在全國開展了多次線下培訓(xùn)班,獲得了大量老師的認(rèn)可和使用。
本次我們推出的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)側(cè)重分析的全面性、靈活性和流暢性,用戶可在平臺(tái)上流暢進(jìn)行各類數(shù)據(jù)分析,快速挖掘數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義。
02 烈冰轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)優(yōu)勢(shì)
可交互頁面全面覆蓋各類分析
圖3:WGCNA分析頁面,選擇基因module后實(shí)時(shí)展示該基因module所影響的Pathway
系統(tǒng)全面覆蓋差異基因、功能分析、聚類分析、網(wǎng)絡(luò)圖、GSEA、趨勢(shì)分析、WGCNA等多種高級(jí)數(shù)據(jù)分析模塊。每個(gè)分析模塊均可隨意調(diào)整參數(shù),并進(jìn)行深度分析。
功能分析和網(wǎng)絡(luò)分析圖毫秒級(jí)展示
圖4:對(duì)差異基因進(jìn)行交并集分析,并對(duì)結(jié)果進(jìn)行各類功能分析
毫秒級(jí)計(jì)算比較組之間的交集和并集,調(diào)整差異基因的卡值(Pvalue、FDR)后實(shí)時(shí)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)圖、各種功能分析和聚類分析圖,順滑繪圖。
用戶界面友好,分析功能全面
圖5:清晰的分析流程,全面覆蓋各類高級(jí)分析,并支持一鍵提交分析
支持多種主流的數(shù)據(jù)分析工具和算法包,用戶可一鍵提交整個(gè)分析流程,也可根據(jù)需要修改各類參數(shù)進(jìn)行定制化分析,兼顧一鍵分析和反復(fù)調(diào)參。
清晰全面的幫助文檔,降低學(xué)習(xí)成本
圖6:每個(gè)分析工具均提供全面的幫助手冊(cè)
幫助手冊(cè)助力用戶進(jìn)行高效的結(jié)果解讀。
分析高度可定制化
圖7:可實(shí)時(shí)查看每個(gè)趨勢(shì)所包含的基因,并對(duì)其進(jìn)行功能分析
單頁面同時(shí)展示基因表達(dá)、趨勢(shì)、火山圖、GO/Pathway、KEGG map、PPI網(wǎng)絡(luò)等一系列分析。同時(shí)每個(gè)結(jié)果都支持用戶自行調(diào)整結(jié)果,實(shí)時(shí)出圖。
03 平臺(tái)注冊(cè)流程
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